本季聚焦于“王政篇”与“夺还战”。艾伦和调查兵团在经历了女巨人等战役后，终于开始触及墙内世界的核心秘密。他们发现真正的敌人不仅是墙外的巨人，还有墙内腐朽的王政和试图维持现状的中央宪兵团。在利威尔兵长等人的策划下，调查兵团发动政变，推翻了虚伪的王室，扶植真正的女王希斯特莉亚上位，并得知了“墙内人类是最后人类”的谎言。随后，为了夺回玛利亚之墙并揭开地下室隐藏的“世界真相”，调查兵团发起了历史上伤亡最惨烈的“玛利亚之墙夺还战”。在与兽之巨人、铠之巨人等的惨烈交锋中，无数战士牺牲，最终他们成功抵达地下室，看到了格里沙·耶格尔留下的照片与书籍，震惊地发现墙外世界依然存在人类文明，而艾尔迪亚人被视为恶魔。